Criada a 7 de novembro de 1966, pela Bula “Quantum Conferat” de Paulo VI, foi instalada canonicamente dia 6 de jameiro de 1967, numa memorável celebração festiva que contou com imensa multidão de fiéis e numerosas autoridades eclesiásticas, civis e militares. Tomou posse, naquele dia, seu primeiro Bispo, Dom Gabriel Paulino Bueno Couto, OC, natural da cidade de Itu. Tem como Padroeira principal Nossa Senhora do Desterro que é também patrona da cidade de Jundiaí desde 1615. O território da nova Diocese foi praticamente todo desembramado da Arquidiocese de São Paulo com exceção de Louveira que pertencia a Campinas.
Fazem parte da Diocese de Jundiaí 63 paróquias em onze cidades, a saber: Jundiaí, Cabreúva, Cajamar, Campo Limpo Paulista, Itu, Itupeva, Louveira, Pirapora do Bom Jesus, Salto, Santana de Parnaíba e Várzea Paulista. A Diocese tem uma população de mais de um milhão de habitantes, dos quais 85% professam a fé católica. Conta hoje com 74 padres diocesanos, 37 religiosos residentes (em 11 congregações), 83 diáconos permanentes, 19 congegações religiosas femininas e 42 seminaristas.
